Ang Indonesian Institute of Sciences (LIPI) gisugdan sa sayong bahin sa ika-16 nga siglo, uban sa pagtuon sa Rumphius sa Indonesian nga tanom. Niadtong 1817, gitukod ni Reinwardt ang Land's Plantentuin, usa ka botanikal nga tanaman sa Bogor, Habagatan sa Jakarta. Niadtong 1928, gitukod sa gobyerno sa Netherlands-Indies ang Netherlands-Indies Council for Natural Science. Ang Council for Science of Indonesia o Majelis Ilmu Pengetahuan Indonesia (MIPI) natukod niadtong 1956. Paglabay sa dose ka tuig, niadtong 1967, ang LIPI, ang Indonesian Institute of Sciences maoy mipuli sa tahas sa Konseho.
Direkta nga nagtaho ang LIPI sa Presidente sa Republika sa Indonesia. Ang nag-unang tahas niini mao ang pagtabang sa Presidente sa pag-organisar sa panukiduki ug kalamboan, paghatag giya ug serbisyo sa syensya ug teknolohiya, ug pagtambag sa gobyerno sa nasudnong palisiya sa syensya ug teknolohiya.
Ang mga gimbuhaton sa LIPI mao ang: 1) pagpahigayon ug panukiduki ug pagpalambo sa syensya ug teknolohiya; 2) paghatag ug giya sa pagpalambo sa siyensiya ug teknolohiya; 3) pag-awhag ug pagpalambo sa kahibalo sa siyensya taliwala sa katawhang Indonesia; 4) pagdasig ug pagpalambo sa siyentipikong komunidad; 5) pagpalambo sa kooperasyon uban sa nasyonal ingon man sa internasyonal nga siyentipikong mga lawas subay sa kasamtangan nga mga balaod ug regulasyon; 6) paghatag ug mga serbisyo nga may kalabotan sa syensya ug teknolohiya, ug 7) pagtambag sa gobyerno sa pagporma sa nasudnong palisiya sa syensya ug teknolohiya.
Ang LIPI nag-empleyo og 4,668 ka personahe, lakip ang 909 ka tigdukiduki sa 18 ka research and development centers ug usa ka Center for Scientific Documentation and Information ubos sa upat ka deputy: Social Sciences and Humanities, Natural Sciences, Engineering Sciences, Development of Scientific Infrastructure, ug General Affairs.
Niadtong Septiyembre 2021, ang LIPI gihiusa sa National Research and Innovation Agency Badan Riset dan Inovasi Nasional (BRIN).