La National Research Foundation (NRF), kiu estis starigita per Ago de Parlamento en 1999, administras la Sudafrikan ISC-Sekretariejon kiel parto de ĝiaj sciencaj interrilataj respondecoj. La misio de la NRF estas certigi la pageblan kaj ekvilibran zorgaĵon de homaj rimedoj kaj kompetenteco en scienco, inĝenieristiko kaj teknologio per la subteno de esplorado kaj eduko por ekonomia kresko kaj socia akcelo de la nacio.
La NRF disponigas subtenon kaj stipendiojn por esplorado, kompetentevoluo, eduko, trejnado, koopera esplorado, stipendioj, nacia kaj internacia scienca partnereco, kaj administras kvin naciajn esplorinstalaĵojn - Themba Laboratory for Accelerator Based Sciences (antaŭe la Nacia Akcelilo-Centro), SA Astronomia. Observatorio, Hartebeesthoek Radio Astronomy Observatory, Suda Afrika Instituto por Akva Biodiverseco (antaŭe la JLB Smith Instituto de Iĥtiologio), kaj Hermanus Magnetic Observatory. Laŭ lastatempa ministeria proklamo per avizo en la Registara Gazeto, la Fundamento por Eduko, Scienco kaj Teknologio estis integrigita en la NRF. ISC-agadoj en Sudafriko estas kunordigitaj tra la ISC Nacia Estraro de Sudafriko kaj Naciaj Komisionoj, kiuj en victurno faras rekomendojn al la NRF, aliaj esplororganizoj, universitatoj, sciencaj socioj, kaj ministerioj.