La SCJ se estableció en 1949 como una "organización especial" bajo la jurisdicción del Primer Ministro, que operaba independientemente del gobierno, con el propósito de promover y mejorar el campo de la ciencia, y hacer que la ciencia se reflejara e impregnara en la administración, las industrias y las personas. vidas.
Representa a los científicos de Japón tanto a nivel nacional como internacional con sus dos funciones: deliberar sobre temas importantes relacionados con la ciencia y ayudar a resolverlos, y; Realizar coordinación entre estudios científicos para lograr una mayor eficiencia.
Para lograr sus objetivos, la SCJ se ha centrado en las siguientes cuatro actividades: recomendaciones de políticas para el gobierno y el público; Actividades internacionales; Promoción de la alfabetización científica y; Establecimiento de redes entre científicos.
Con sus 210 miembros del Consejo y unos 2000 miembros de una amplia gama de campos que abarcan las humanidades y las ciencias sociales, las ciencias de la vida, así como las ciencias físicas y la ingeniería, SCJ lleva a cabo sus actividades desde una perspectiva universal y un punto de vista integral y multifacético. por la solidez de la ciencia y la sociedad humana y el bienestar de toda la humanidad.