Kristallograafid ühinevad koroonaviirusega võitlemiseks

. IUCr veebisait tõstab esile mitmeid olulisi avastusi ja pakub linke tasuta saadaolevatele ressurssidele koroonaviiruse ja COVID-19 uurimiseks. Toome esile mõned IUCr-i poolt kirjeldatud edusammud:

Kell Texase ülikool (TÜ) Ameerika Ühendriikides, Jason McLellan on kasutanud koroonaviiruse piigivalgu struktuuri määramiseks tipptehnoloogiat, mida tuntakse krüogeense elektronmikroskoopia (cryo-EM) nime all. Cryo-EM võimaldab teadlastel luua rakustruktuuride, molekulide ja viiruste aatomiskaala 3D-mudeleid. Pärast seda, kui Hiina teadlased avaldasid uue koroonaviiruse järjestuse, konstrueerisid dr McLellan ja tema meeskond teraviljavalgu variandi, et suurendada selle stabiilsust ja ekspressiooni uurimiseks, ning andis korralduse sünteesida nukleiinhapet modifitseeritud piigivalgu jaoks. Sees 25 päeva Pärast konstrueeritud nukleiinhappe saamist kloonisid nad geeni, ekspresseerisid valku, isoleerisid selle, kasutasid ülikooli krüo-EM-seadet struktuuri määramiseks ja esitasid oma töö teadus, kus see on juba olnud avaldatud.

2019-nCoV spike-valgu struktuur prefusiooni konformatsioonis

See on 3-nCoV spikeproteiini 2019D-aatomiskaala kaart või molekulaarstruktuur. Valk omandab kaks erinevat kuju, mida nimetatakse konformatsiooniks – üks enne peremeesraku nakatamist ja teine nakatumise ajal. See struktuur esindab valku enne, kui see rakku nakatab, mida nimetatakse prefusioonikonformatsiooniks (pilt on tehtud Austini Texase ülikooli loal).

IUCr-i endine president Marvin Hackert kasutas dr McLellani koordinaate, et toota 3D-prinditud mudel, mida dr McLellan näitas Fox National Newsis USA-s ja WXYZ-TV Detroidis.

Vahepeal hiljutine Poola-Saksa ühine kristallograafiakohtumine Poolas Wroclawis algas Rolf Hilgenfeldi (Lüübecki Ülikool, Saksamaa) täiskogu loenguga „SARSist MERSi ja 2020. aasta Wuhani kopsupõletiku viiruseni – kuidas röntgenkristallograafia võib aidata võidelda esilekerkivate viirustega”. Esitati tulemused, mis saadi alles sel päeval. Lisateavet nende lugude kohta leiate peagi ilmuvast ajakirjanumbrist IUCr uudiskiri, ja saidil on saadaval mitmeid lisaressursse IUCr veebisait, mida regulaarselt uuendatakse.

Virtuaalne number, mis sisaldab kõiki IUCr ajakirjades avaldatud artikleid ja kokkuvõtteid koroonaviiruste kohta, on saadaval tasuta loetavas kogumikus siin.

Foto: uudne koroonaviirus SARS-CoV-2 (NIAID Flickri kaudu)