Le vice-ministère de la Science et de la Technologie (Viceministerio de Ciencia y Tecnología de El Salvador) a été créé en juin 2009 par décret exécutif (n° 12, article 1) au sein du ministère de l'Éducation. Il a été créé pour introduire la technologie éducative dans les écoles du pays et relier les domaines technologique, scientifique, éducatif et productif du pays.
Sa mission est d'introduire des activités pour la science, la technologie et l'innovation dans le pays, en contribuant à d'autres instances du ministère de l'Éducation, pour fournir une capacité professionnelle pour la création et l'utilisation de connaissances ; de mieux définir et élaborer la Politique nationale de développement scientifique et technologique. Ceci est soutenu par la consultation et la prospective technologique en collaboration avec d'autres ministères, agences et plateformes institutionnelles nationales ; permettre et faciliter le développement de la recherche scientifique, technologique et innovante ayant un impact positif et significatif sur la qualité de vie de la population salvadorienne.
En ce sens, des actions visant à l'introduction des Technologies de l'Information et de la Communication (TIC) comme outil dans le processus d'enseignement sont en cours de développement – apprentissage, introduction de l'accent mis sur la Science, la Technologie et l'Innovation (CTI) dans l'éducation, attention aux étudiants avec des performances exceptionnelles et une formation technique et technologique supérieure
Dans le domaine de la recherche, en 2010, deux centres de recherche ont été créés : le Centre de recherche scientifique d'El Salvador (CICES) et le Centre national des sciences sociales et humaines (CENISCH) et le Parc technologique ont été créés dans l'agroalimentaire (PTA, 2013) et la création d'un Parc Technologique en Sciences Exactes et Ingénierie est prévue. Le système national d'innovation a également été formé, ainsi que des instruments juridiques pour le développement de la science, de la technologie et de l'innovation : la loi sur le développement scientifique et technologique, la politique nationale de l'innovation, de la science et de la technologie et un plan national pour un agenda scientifique et technologique. Des instruments ont été créés pour la gouvernance de la CTI, tels que le Comité interministériel de la science, de la technologie et de l'innovation, et le Conseil consultatif du Comité interministériel et du Comité de coordination de la CTI.