L'Académie pontificale des sciences a vu le jour en 1603 sous le nom de Linceorum Academia, a été réorganisée en 1847 sous le nom de Pontificia Academia dei Nuovi Lincei et a été reconstituée avec son nom actuel par le pape Pie XI en 1936. Son objectif est de promouvoir le progrès de la mathématique, de la physique et les sciences naturelles et l'étude des problèmes épistémologiques connexes. Son travail est de portée internationale et ses 80 académiciens pontificaux sont membres du monde entier et non confessionnels.
L'Académie tient des sessions plénières et organise des semaines d'études et des groupes de travail liés aux questions de science fondamentale, de problèmes mondiaux, de politique scientifique et de bioéthique. En outre, l'Académie publie les Actes de ses propres réunions, ainsi que les résultats de la recherche scientifique et des études des académiciens et autres scientifiques. Il décerne la Médaille Pie XI à de jeunes scientifiques exceptionnels.