Alex Godoy est directeur du Centre de recherche sur le développement durable à l'École d'ingénierie de l'Université del Desarrollo au Chili, associé de recherche au Earth Engineering Center de l'Université Columbia et chercheur au Weatherhead Center for International Affairs de l'Université Harvard.
Il a été membre de conseils consultatifs d'institutions gouvernementales telles que le ministère de la Science, de la Technologie, de la Connaissance et de l'Innovation, le ministère des Finances, le ministère de l'Environnement ainsi que membre des commissions présidentielles du ministère de l'Énergie.
En 2015, il a été membre de la délégation chilienne à la Conférence des Nations Unies sur les changements climatiques (COP21) et membre du comité scientifique de la Conférence des Nations Unies sur les changements climatiques (COP25). Au niveau international, il a été membre du Comité directeur du Groupe d'experts de haut niveau sur la sécurité alimentaire et la nutrition du Comité de la sécurité alimentaire mondiale – Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (CFS-FAO), rédacteur en chef du groupe de travail. III du sixième rapport d'évaluation du Groupe d'experts intergouvernemental sur l'évolution du climat (GIEC) ; auteur principal de Global Environment Outlook 6 pour Business and Global Environment Outlook (GEO7) au Programme des Nations Unies pour l'environnement (PNUE) ; et auteur principal de Nexus Assessment à la Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES). En 2020, il a été l'un des auteurs du rapport '10 New Insights in Climate Science', de Future Earth et membre du comité ISO/TC 323 de la norme en préparation ISO/WD 59004 Économie circulaire. Enfin, en 2019, il a été nommé Docteur Honoris Causa – Docteur en droit de l’Université du Wisconsin – Green Bay pour ma contribution à la création de politiques publiques et d’innovations dans le secteur privé en matière de durabilité.
Ses recherches sur le terrain portent sur la science du développement durable en évaluant les impacts du commerce de la comptabilité des flux de matières.