Il est diplômé en génie électronique de l'Institut de technologie aéronautique de (ITA dans l'acronyme portugais). Il a obtenu une maîtrise et un doctorat à l'Institut de physique Gleb Wataghin d'Unicamp. Il est professeur à l'Institut de physique de l'Unicamp depuis 1982. Il est actuellement professeur titulaire au Département d'électronique quantique.
Brito Cruz est membre de l'Académie brésilienne des sciences et membre de l'Association américaine pour l'avancement des sciences. Il a reçu l'Ordre des Palmes académiques de France, l'Ordre du mérite scientifique de la République fédérative du Brésil et l'Ordre de l'Empire britannique, honorifique (OBE) en 2015.
Brito Cruz a été chercheur invité au Quantum Optics Laboratory de l'Universitá di Roma, au Femtosecond Research Laboratory de l'Universitè Pierre et Marie Curie, et chercheur résident aux Bell Laboratories d'AT&T, à Holmdel, New Jersey et à Murray Hill, NEW JERSEY. A l'Unicamp, il a été directeur de l'Institut de physique d'Unicamp de 1991 à 1994 et de 1998 à 2002 ; Pro-recteur à la recherche de 1994 à 1998, et recteur de l'université de 2002 à 2005. Il a été président de la FAPESP de 1996 à 2002.