La Pontificia Accademia delle Scienze nacque nel 1603 come Linceorum Academia, fu riorganizzata nel 1847 come Pontificia Academia dei Nuovi Lincei, e fu ricostituita con il nome attuale da Papa Pio XI nel 1936. Il suo scopo è promuovere il progresso delle scienze matematiche, fisiche e scienze naturali e lo studio dei relativi problemi epistemologici. Il suo lavoro è di portata internazionale e la sua appartenenza a 80 Accademici Pontifici è mondiale e non settaria.
L'Accademia tiene sessioni plenarie e organizza settimane di studio e gruppi di lavoro relativi a questioni di scienza fondamentale, problemi globali, politica scientifica e bioetica. Inoltre, l'Accademia pubblica gli Atti dei propri incontri, i risultati delle ricerche e degli studi scientifici degli Accademici e di altri scienziati. Assegna la Medaglia Pio XI a giovani scienziati eccezionali.