Eugenia Kalnay è Distinguished University Professor presso il Dipartimento di Scienze Atmosferiche e Oceaniche dell'Università del Maryland (UMD). Prima di entrare a far parte di UMD, il Dr. Kalnay è stato Branch Head presso la NASA Goddard, e in seguito Direttore dell'Environmental Modeling Center (EMC) dei National Centers for Environmental Prediction (NCEP, precedentemente NMC), National Weather Service (NWS) dal 1987 al 1997. Durante quei dieci anni ci furono importanti miglioramenti nell'abilità previsionale dei modelli NWS. Molti progetti di successo come la rianalisi NCEP/NCAR di oltre 60 anni (il documento su questa rianalisi è stato citato più di 10,000 volte), previsioni dinamiche stagionali e interannuali, la prima previsione di insieme operativo, assimilazione di dati variazionali 3-D e 4-D, controllo di qualità avanzato e previsioni oceaniche costiere. EMC è diventato un pioniere sia nella scienza fondamentale che nelle applicazioni pratiche delle previsioni meteorologiche numeriche.
Gli attuali interessi di ricerca del Dr. Kalnay riguardano la previsione meteorologica numerica, l'assimilazione dei dati, la prevedibilità e la previsione dell'insieme, la modellazione accoppiata oceano-atmosfera e il cambiamento climatico e la sostenibilità. Zoltan Toth ed Eugenia Kalnay hanno introdotto il metodo di allevamento per la previsione dell'insieme. È anche autrice (con Ross Hoffman e Wesley Ebisuzaki) di altri metodi di ensemble ampiamente utilizzati noti come Lagged Averaged Forecasting e Scaled LAF. Il suo libro, Atmospheric Modeling, Data Assimilation and Predictability (Cambridge University Press, 2003) è andato esaurito in un anno, è ora alla sua quinta ristampa ed è stato pubblicato in cinese (2005) e in coreano (2012). Ha ricevuto numerosi premi, tra cui il Premio IMO 2009 dell'Organizzazione meteorologica mondiale, ed è stata membro del Comitato consultivo scientifico delle Nazioni Unite (2013), ed è membro del Comitato consultivo scientifico NOAA (2016) e di altri comitati scientifici.