បណ្ឌិត្យសភាវិទ្យាសាស្ត្រគុយបាដើមត្រូវបានបង្កើតឡើងក្រោមក្រោនអេស្ប៉ាញនៅថ្ងៃទី 19 ខែឧសភា ឆ្នាំ 1861 ជារាជបណ្ឌិតសភាវេជ្ជសាស្ត្រ រូបវិទ្យា និងវិទ្យាសាស្ត្រធម្មជាតិនៃទីក្រុងហាវ៉ាណា។ នៅឆ្នាំ 1902 បណ្ឌិតសភាបានរក្សារចនាសម្ព័ន្ធ និងអង្គការរបស់ខ្លួន ប៉ុន្តែបានទម្លាក់ពីឈ្មោះរបស់វាថា "រាជ" ដូចដែលវាបានចាប់ផ្តើមធ្វើសកម្មភាពនៅក្នុងបរិយាកាសសាធារណៈរដ្ឋ។ នៅឆ្នាំ 1962 គណៈកម្មការជាតិសម្រាប់បណ្ឌិត្យសភាវិទ្យាសាស្ត្រនៃប្រទេសគុយបាត្រូវបានបង្កើតឡើង ដែលផ្តល់សិទ្ធិជាលើកដំបូងជាមួយនឹងវិសាលភាពជាតិ។ នៅឆ្នាំ 1980 បណ្ឌិត្យសភាត្រូវបានដំឡើងឋានៈជាក្រសួង ដែលទទួលខុសត្រូវផ្នែកកណ្តាលនៃសកម្មភាពវិទ្យាសាស្ត្រ និងបច្ចេកវិទ្យា។ នៅឆ្នាំ 1994 រចនាសម្ព័ន្ធរដ្ឋបាលនៃបណ្ឌិត្យសភាបានរួមបញ្ចូលគ្នាជាមួយគណៈកម្មការជាតិសម្រាប់បរិស្ថាន និងធនធានធម្មជាតិ និងលេខាធិការដ្ឋានប្រតិបត្តិសម្រាប់កិច្ចការនុយក្លេអ៊ែរ ដើម្បីបង្កើតជាក្រសួងវិទ្យាសាស្ត្រ បច្ចេកវិទ្យា និងបរិស្ថាន។
នៅខែមេសា ឆ្នាំ 1996 បណ្ឌិត្យសភាវិទ្យាសាស្ត្រគុយបា (Academia de Ciencias de Cuba) ត្រូវបានបង្កើតឡើងដោយច្បាប់ក្នុងលក្ខណៈបច្ចុប្បន្នរបស់ខ្លួនជាស្ថាប័នផ្លូវការរបស់រដ្ឋគុយបា ដោយមានលក្ខណៈឯករាជ្យ និងពិគ្រោះយោបល់ក្នុងបញ្ហាវិទ្យាសាស្ត្រ។
គោលបំណងនៃបណ្ឌិត្យសភាវិទ្យាសាស្ត្រគឺដើម្បីជំរុញវិទ្យាសាស្ត្រគុយបា ការផ្សព្វផ្សាយវឌ្ឍនភាពវិទ្យាសាស្ត្រជាតិ និងសកល ការទទួលស្គាល់កិត្យានុភាពសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវវិទ្យាសាស្ត្រប្រកបដោយឧត្តមភាព លើកកម្ពស់ស្តង់ដារវិជ្ជាជីវៈប្រកបដោយក្រមសីលធម៌ និងការទទួលស្គាល់សង្គមនៃវិទ្យាសាស្ត្រ និងពង្រឹងទំនាក់ទំនងអ្នកវិទ្យាសាស្ត្រ និង អង្គការរបស់ពួកគេ ក្នុងចំណោមពួកគេ ជាមួយសង្គមទាំងមូល និងជាមួយពិភពលោកទាំងមូល។
បណ្ឌិត្យសភាមានបុគ្គលិកជំនាញដែលគាំទ្រគណៈអភិបាលក្នុងការបំពេញភារកិច្ចរបស់ពួកគេ។ អ្នកសិក្សាជាកម្មសិទ្ធិរបស់ផ្នែករបស់បណ្ឌិត្យសភា ដែលត្រូវបានរៀបចំឡើងតាមក្រុមនៃវិញ្ញាសាវិទ្យាសាស្ត្រ៖ វិទ្យាសាស្ត្រជីវវេជ្ជសាស្ត្រ វិទ្យាសាស្ត្រកសិកម្ម និងនេសាទ វិទ្យាសាស្ត្របច្ចេកទេស វិទ្យាសាស្ត្រសង្គម និងមនុស្សសាស្ត្រ និងវិទ្យាសាស្ត្រធម្មជាតិ និងពិតប្រាកដ។