Matemático de formação, Jean-Pierre BOURGUIGNON fez toda a sua carreira no Centro Nacional de Pesquisa Científica (1969-2013). Sua área de atuação é Geometria Diferencial com foco em questões geométricas na interface da Física Teórica. Ele ensinou em École Polytechnique (1986-2012). Foi o Diretor do Instituto de Altos Estudos Científicos em Bures-sur-Yvette (1994-2013).
Ele já foi presidente da Sociedade Matemática da França (1990-1992), e da European Mathematical Society (1995-1998). Ele ocupou o cargo de Presidente do Conselho Europeu de Pesquisa (ERC) (2014-2019), depois interino (julho 2020-agosto 2021).
Em 1987, a Académie des Sciences de Pariss lhe concedeu o Prêmio Paul Langevin e, em 1997, o Prix du Rayonnement français pour les sciences physiques et mathématiques.
Ele é um membro da Academia Europaea, da Real Academia Espanhola de Ciências, da Academia Portuguesa de Ciências e da Real Academia de Ciências de Barcelona. Recebeu vários títulos de Doutor Honoris Causa: em 2008 pela Keio University (Japão), em 2011 pela Nankai University (China) e em 2018 pela University of Edinburgh (Escócia). Em 2005, foi eleito Membro Honorário da London Mathematical Society, em 2017 da Deutsche Mathematiker Vereinigung e em 2019 da Sociedade Matemática Polonesa.