Matematician de pregătire, Jean-Pierre BOURGUIGNON și-a făcut toată cariera la Centrul Național de Cercetări Științifice (1969-2013). Domeniul său este Geometria Diferenţială, cu accent pe întrebările geometrice la interfaţa Fizicii Teoretice. A predat la Școala Politehnică (1986-2012). El a fost directorul Institut des Hautes Études Scientifiques în Bures-sur-Yvette (1994-2013).
A fost președinte al Societatea Matematică a Franței (1990-1992) și a Societății Europene de Matematică (1995-1998). A deținut funcția de președinte al Consiliului European pentru Cercetare (ERC) (2014-2019), apoi interimar (iulie 2020-august 2021).
În 1987, Académie des Sciences de Paris i-a acordat Premiul Paul Langevin, apoi în 1997 Prix du Rayonnement français pentru științe fizice și matematice.
El este membru al Academia Europaea, al Academiei Regale de Științe Spaniole, al Academiei Portugheze de Științe și al Academiei Regale de Științe din Barcelona. A primit mai multe titluri de Doctor Honoris Causa: în 2008 de către Universitatea Keio (Japonia), în 2011 de către Universitatea Nankai (China) și în 2018 de către Universitatea din Edinburgh (Scoția). În 2005, a fost ales membru de onoare al Societății de Matematică din Londra, în 2017 al Deutsche Mathematiker Vereinigung și în 2019 a Societății poloneze de matematică.