Заступник Міністерства науки і технологій (Viceministerio de Ciencia y Tecnología de El Salvador) було створено в червні 2009 року виконавчим декретом (№ 12, стаття 1) як частину Міністерства освіти. Він був створений для запровадження освітніх технологій у школах країни та зв’язку між технологіями, наукою, освітою та продуктивністю в країні.
Його місія полягає в тому, щоб запровадити діяльність в галузі науки, техніки та інновацій в країні, сприяючи іншим інстанціям Міністерства освіти, забезпечити професійний потенціал для створення та використання знань; подальше визначення та розробка Національної політики науково-технічного розвитку. Це підкріплюється консультаціями та технологічним прогнозуванням у поєднанні з іншими міністерствами, відомствами та національними інституційними платформами; уможливити та сприяти розвитку наукових, технологічних та інноваційних досліджень, які позитивно та суттєво впливають на якість життя населення Сальвадору.
У цьому сенсі розробляються дії, спрямовані на впровадження інформаційних технологій та комунікацій (ІКТ) як інструменту в навчальний процес – навчання, запровадження орієнтації на науку, технології та інновації (ІКТ) в освіті, увага до учнів. з видатними показниками та вищою технічною та технологічною освітою
У сфері досліджень у 2010 році було створено два дослідницькі центри: Науково-дослідний центр Сальвадору (CICES) та Національний центр соціальних і гуманітарних наук (CENISCH), а також технологічний парк в агробізнесі (PTA, 2013). планується створення технологічного парку точних наук і техніки. Також сформовано Національну інноваційну систему, правові інструменти розвитку науки, техніки та інновацій: Закон про науково-технічний розвиток, Національну політику щодо інновацій, науки і технологій та Національний план наукового порядку денного та технологій. Були створені інструменти для управління CTI, такі як Міжміністерський комітет з науки, технологій та інновацій та Консультативна рада Міжміністерського комітету та Координаційний комітет CTI.