Ile-ẹkọ giga ti Cuba atilẹba ti Awọn sáyẹnsì ni ipilẹ labẹ ade Ilu Sipeeni ni ọjọ 19 Oṣu Karun ọdun 1861 gẹgẹbi Ile-ẹkọ giga Royal ti Iṣoogun, Ti ara, ati Awọn sáyẹnsì Adayeba ti Havana. Ni ọdun 1902 Ile ẹkọ ẹkọ ẹkọ ṣe idaduro eto ati eto rẹ ṣugbọn o lọ silẹ lati orukọ rẹ ọrọ "Royal", bi o ti bẹrẹ ṣiṣe ni agbegbe olominira ti orilẹ-ede. Ni ọdun 1962 Igbimọ Orilẹ-ede fun Ile-ẹkọ giga ti Awọn sáyẹnsì ti Kuba ni a ṣẹda, ti a fun ni fun igba akọkọ pẹlu iwọn orilẹ-ede kan. Ni ọdun 1980 Ile-ẹkọ giga naa ni igbega si ipo ti Ile-iṣẹ ijọba, ni aringbungbun ni idiyele gbogbo iṣẹ ṣiṣe imọ-ẹrọ ati imọ-ẹrọ. Ni 1994, eto iṣakoso ti Ile-ẹkọ giga ti dapọ pẹlu Igbimọ Orilẹ-ede fun Ayika ati Awọn orisun Adayeba, ati Akọwe Alase fun Awọn ọran iparun, lati ṣe agbekalẹ Ile-iṣẹ fun Imọ-ẹrọ, Imọ-ẹrọ, ati Ayika.
Ni Oṣu Kẹrin ọdun 1996, Ile-ẹkọ giga ti Awọn sáyẹnsì ti Kuba (Academia de Ciencias de Cuba) jẹ idasilẹ nipasẹ ofin ni ihuwasi rẹ lọwọlọwọ bi ile-iṣẹ osise ti Ipinle Cuba, pẹlu ẹda ominira ati ijumọsọrọ ni awọn ọran ti imọ-jinlẹ.
Awọn ibi-afẹde ti Ile-ẹkọ giga ti Awọn sáyẹnsì ni lati ṣe idagbasoke imọ-jinlẹ Cuban, itankale ti orilẹ-ede ati ilọsiwaju ti imọ-jinlẹ ti gbogbo agbaye, idanimọ ọlá fun iwadii imọ-jinlẹ ti didara julọ, lati gbe awọn iṣedede alamọdaju ihuwasi ati idanimọ awujọ ti imọ-jinlẹ, ati lati teramo awọn ọna asopọ ti awọn onimọ-jinlẹ ati awọn ajo wọn, laarin ara wọn, pẹlu awujọ ni gbogbogbo, ati pẹlu iyoku agbaye.
Ile-ẹkọ giga naa ni oṣiṣẹ alamọdaju ti o ṣe atilẹyin fun Awọn ẹgbẹ Alakoso ni imuse awọn iṣẹ ṣiṣe wọn. Awọn ọmọ ile-iwe giga jẹ ti Awọn apakan Ile-ẹkọ giga, eyiti a ṣeto ni ibamu si awọn ẹgbẹ ti awọn ilana imọ-jinlẹ: Awọn sáyẹnsì Biomedical, Awọn imọ-jinlẹ Igbẹ ati Ipeja, Awọn imọ-ẹrọ Imọ-ẹrọ, Awọn imọ-jinlẹ Awujọ ati Awọn Eda Eniyan, ati Adayeba ati Awọn imọ-jinlẹ Gangan.