Mercedes Bustamante este profesor la Universitatea din Brasilia, Brazilia, și membru al Academia braziliană de științe. A fost co-coordonatoare a capitolului Agricultură, silvicultură și alte utilizări ale terenului al celui de-al cincilea raport al Grupului interguvernamental privind schimbările climatice (IPCC), autor principal coordonator al capitolului Motori direcți și indirecți ai schimbării biodiversității și contribuțiilor naturii la oameni al primei evaluări regionale pentru America a Platformei interguvernamentale știință-politică privind biodiversitatea și serviciile ecosistemice (IPBES), reprezentant al Americii Latine în Inițiativa Internațională pentru Azot, membru al Comitetului științific al Programului Internațional Geosferă-Biosferă (IGBP), Programul Biosfera-Atmosferă din Amazon (LBA) și Comitetul de conducere independent al Programului de cercetare CGIAR privind schimbările climatice, agricultura și securitatea alimentară (CCAFS). În managementul politicilor științifice și educaționale, a contribuit în calitate de coordonator general al managementului ecosistemelor și director al politicilor și programelor tematice din Ministerul brazilian al științei, tehnologiei și inovării și ca director al programelor braziliene și al bursei de coordonare a dezvoltării personalului ( CAPES, în portugheză). În prezent, este membră a Comitetului științific de conducere al Panoul științific pentru Amazon și autorul principal al celui de-al șaselea raport de evaluare al IPCC (Grupul de lucru III).