Mercedes Bustamante on Brasiilia ülikooli professor ja Brasiilia ülikooli liige Brasiilia Teaduste Akadeemia. Ta oli peatüki koordinaator Põllumajandus, metsandus ja muu maakasutus peatüki koordineeriva juhtivautori valitsustevahelise kliimamuutuste paneeli (IPCC) 5. aruandest Bioloogilise mitmekesisuse muutuste otsesed ja kaudsed tõukejõud ning looduse panus inimestesse Bioloogilise mitmekesisuse ja ökosüsteemiteenuste valitsustevahelise teaduspoliitika platvormi (IPBES) esimese Ameerika piirkondliku hindamise, Ladina-Ameerika esindaja rahvusvahelises lämmastikualgatuses, rahvusvahelise geosfääri-biosfääri programmi (IGBP) teaduskomitee liige. Amazonase biosfääri-atmosfääri programm (LBA) ja CGIARi kliimamuutuste, põllumajanduse ja toiduga kindlustatuse uurimisprogrammi (CCAFS) sõltumatu juhtkomitee. Teadus- ja hariduspoliitika juhtimises on ta panustanud Brasiilia teadus-, tehnoloogia- ja innovatsiooniministeeriumi ökosüsteemi juhtimise üldkoordinaatori ja poliitikate ja temaatiliste programmide direktorina ning Brasiilia personaliarenduse koordineerimise programmide ja stipendiumide direktorina ( KEEMI, portugali keeles). Praegu on ta teaduse juhtkomitee liige Amazonase teaduspaneel ja IPCC (III töörühm) 6. hindamisaruande juhtiv autor.